Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms