Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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