Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Ccdc39Q9D5Y1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ccdc39Q9D5Y1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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