Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms