Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4931428L18RikQ9D4S9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms