Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcc1Q9D4H2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms