Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp4Q9D4F8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms