Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pus10Q9D3U0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms