Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SarnpQ9D1J3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms