Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D1F3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D1F3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D1F3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms