Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc3Q9D114 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms