Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms