Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms