Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrs1Q9CYH6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms