Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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