Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RpainQ9CWY9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms