Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin4Q9CWW6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms