Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Malsu1Q9CWV0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms