Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx10Q9CWT3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx10Q9CWT3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms