Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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