Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms