Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sycp2Q9CUU3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp2Q9CUU3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms