Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg12Q9CQY1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms