Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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