Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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