Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms