Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms