Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg3Q9CPX6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms