Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms