Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ms4a4dQ99N05 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ms4a4dQ99N05 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ms4a4dQ99N05 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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