Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp1b4Q99ME6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms