Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaipQ99ME3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms