Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms