Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SardhQ99LB7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms