Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms