Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms