Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms