Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SptssbQ925E8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms