Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prss28Q924N9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms