Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csmd1Q923L3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms