Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms