Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb6Q922F4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms