Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms