Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg13Q91YI1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms