Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Creb3l3Q91XE9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms