Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BsndQ8VIM4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms