Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms