Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Stx18Q8VDS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Stx18Q8VDS8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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