Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rprd1aQ8VDS4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms