Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sf3b4Q8QZY9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms